第二期(112-116年)高教深耕計畫以本校校務發展計畫為藍圖，延續第一期高教深耕之成果與反思，持續依學生學習、教師教學與特色資源面向調整規劃與推展：
■學生學習面：由學用共融的客製化學習轉型學生成為具航向及學習動力的知識汲取者。
■教師教學面：由因材施教的引導式角色導引學生成為具前瞻及跨域整合的永續發展者。
■特色資源面：由共享共作的校特色資源翻轉為以學生為本具共享與同理心之溫度校園。
高教深耕理念是永續發展的，本期將以『創造最具有學習動能、前瞻跨域、人文溫度、社會影響之綠色永續大學』為推動總目標，持續實踐高教使命並透過四大面向14個分項創新策略與分針，輔以持續改進的管考機制及利害關係人意見回饋，深耕第二期高教深耕推動。本期整體發展架構圖如下所示：
本校計畫執行績效與經費進度管控機制遵循PDCA，由「高教深耕計畫推動委員會」監督，校務研究處負責業務執行及經費控管、計畫成果等。高教深耕計畫推動委員會則由校長擔任主任委員，委員會成員為執行計畫之各單位一級主管，委員會原則每季召開乙次會議，視需求召開臨時會議，審議各單位經費及考核執行績效，並依據會議檢討與修正計畫執行方向，建立永續發展機制與配套措施。
